幽门螺杆菌感染是人类较为常见的慢性感染之一，感染后一般难以自发清除，临床中清除幽门螺杆菌比较好的药物是4联药物，包括一种抑酸药物，两种抗生素，一种铋剂。
患者可以遵医嘱使用阿莫西林联合四环素，或者是阿莫西林联合呋喃唑酮，如果对青霉素过敏，可以选择四环素加甲硝唑，或四环素加呋喃唑酮，或四环素加左氧氟沙星，或克拉霉素加呋喃唑酮，或克拉霉素加甲硝唑，或克拉霉素加左氧氟沙星。
同时在服药的过程中要注意避免饮酒，少吃辛辣、刺激性食物。四联药物常规口服14天，14天后停药1个月，进一步复查幽门螺杆菌有没有完全清除，如果没有清除，建议间隔半年到一年以上再次清除幽门螺杆菌，同时调换药物。
如第一次用过的抗生素，第二次尽量避免使用，有条件的患者可以做细菌耐药试验以及药敏试验，选择对细菌比较敏感的抗生素会更好。