男性HPV感染，部分患者是可以自愈的，还有部分患者需要进行治疗。
有的时候HPV感染是一过性的，可能在这次检查的时候是阳性的，有可能3个月再查的时候就是阴性。当然，也有部分患者HPV感染是持续存在的，需要通过药物转阴，比如干扰素，或者提高免疫的药，比如脾氨肽等。平时加强运动，生活规律，早睡早起，让机体免疫力增强。
HPV感染也有部分患者是会转阴的，有少部分HPV感染的患者，可能会引起疣体的增生，如果长在生殖器部位，叫做尖锐湿疣。尖锐湿疣也有少部分患者可能会自愈，但是大多数患者都可能会从一个变成两个，越长越多。
如果出现疣体，建议进行积极的治疗。在日常的生活中要洁身自好，不要进行高危性生活。当感染HPV的时候，首先要看是否有临床症状出现，如果没有，可以选择观察，也可以选择用药。
如果出现疣体以后，就必须进行治疗，可以选择液氮冷冻治疗，或者是激光治疗，也可以选择光动力疗法，也可以药物和物理疗法联合进行治疗。