蛋白尿的发生原因，根据患者是否存在肾脏的器质性病变，可以分为生理性的蛋白尿以及病理性的蛋白尿。生理性的蛋白尿包括了功能性蛋白尿以及体位性蛋白尿。
1、功能性蛋白尿：通常患者肾脏没有器质性病变，一般会出现一过性的暂时性的蛋白尿，尿蛋白定量通常<1g/d，正常人在剧烈运动或者发热、寒冷、紧张等交感神经兴奋的状态下出现的蛋白尿，或者是正常人过度的摄入蛋白质饮食之后，也可以出现一过性蛋白尿。
2、体位性的蛋白尿：也是生理性蛋白尿，通常也是<1g/d。患者一般是瘦长体型的儿童和青少年，患者的尿蛋白会在卧位时休息消失，而立位时出现，通常见于左肾静脉胡桃夹征，即左肾静脉在肠系膜上动脉和腹主动脉的夹角之间存在，受到压迫，而导致左肾静脉压力升高，出现蛋白尿。
3、病理性的蛋白尿：包括各种原发性的或继发性的肾脏疾病，和遗传性的疾病导致的蛋白尿，特点是蛋白尿持续存在，同时可以伴有血尿，水肿，高血压，肾功能不全等表现。可以分为肾小球源性的蛋白尿，是因为肾小球滤过膜受到损伤，而导致通透性升高所致。
肾小管性的蛋白尿，是因为肾小管对于肾小球正常滤过的蛋白质 重吸收功能受损，而导致出现蛋白尿，可以见于各种类型的肾小管间质病变，比如慢性肾盂肾炎或者是低钾肾病等。
溢出性蛋白尿，也可以引起患者出现病理性的蛋白尿，是因为患者体内小分子量蛋白质异常的增多，经过肾小球滤过而超过了肾小管重吸收的能力。此外，还有一种分泌性的蛋白尿，肾小管和下尿路分泌蛋白质而导致的蛋白尿，可以见于肾小管的炎症以及尿路的肿瘤。