指甲盖凸凹不平，可能是由于甲真菌病、甲营养不良等原因导致的。
1、甲真菌病：也就是甲癣也叫灰指甲，主要是真菌感染造成的，需要抗真菌治疗，如果只有单个指甲受累，以外用抗真菌药为主。如果超过3-4个指甲受累，则需要加口服的抗真菌药。
2、甲营养不良：甲营养不良也会造成指甲不光滑，不平整，大多数情况是缺钙或者缺乏角蛋白。这种情况以食补为主，主要吃含钙比较丰富的食物，还有含角蛋白比较丰富的食物，如猪脚等。
3、全身性疾病：也会导致指甲凸凹不平，比较常见的有银屑病，银屑病可以造成银屑病甲表面凸凹不平，临床上也称之为顶针状甲。需要治疗全身性疾病，随着全身性疾病的改善，指甲也会变得光滑。
4、外伤后造成甲母质受损：长出的指甲也会凸凹不平的情况，往往很难恢复，最后还有假扁平苔藓，也会造成指甲脱不平，没有光泽。