甲状腺抗体分为甲状腺球蛋白抗体和甲状腺过氧化物酶抗体，甲状腺抗体增高并不一定说明甲状腺本身分泌功能出现问题，可能出现调节的异常，就是身体针对甲状腺产生这类特异性的抗体。
特异性抗体是针对甲状腺滤泡细胞产生的免疫反应，随着时间抗体可能会持续引起免疫介导的损伤，对甲状腺自身造成破坏。当破坏到身体不能代偿足够产生甲状腺素的时候，会出现甲状腺功能异常。
临床上主要表现为甲状腺功能减退，从发现甲状腺抗体到出现甲状腺功能减退有一个时间，一般认为至少超过3-5年才会逐渐出现，建议定期复查。
早期没有出现甲状腺刺激激素或者甲状腺游离T3、T4的变化，暂时不需要用药处理，若出现甲状腺激素的异常，如甲状腺激素增高或者是甲状腺的甲状腺素游离T4的降低，才建议补充甲状腺素。