双肾结晶的治疗主要通过增加饮水次数、增加运动量以及口服排石药物，还有可以通过饮食调整。
1、增加饮水次数：增加每天的饮水量，一般要求每1h饮一次水，每次饮水量约为200mL，一般总的饮水量要超过2000mL。
2、增加运动量：肾结晶通过多运动，能够促进肾内小结晶的排出，运动以跳跃运动为主，如跳绳、跳台阶、跑步，每天跳跃运动要超过1h。
3、口服排石药物：肾的小结晶可以通过服用肾石通颗粒、复方金钱草颗粒等排石药物，促进结晶排出，能够起到利尿、排石、消炎等作用，但这类排石药物对肝、肾等器官有一定的副作用，不能长期服用，要在医生指导下用药。
4、饮食调整：低脂、低盐饮食，少吃含钙高、含嘌呤高的食物等方式治疗。