厌氧菌感染抗菌药物的选用应根据细菌培养及药物敏感试验的结果而定。常用的抗厌氧菌药物有甲硝唑、克林霉素和林可霉素、氯霉素、万古霉素和去甲万古霉素等。
1、甲硝唑：对大多数厌氧菌均有杀菌作用。在临床上，甲硝唑对腹腔内感染、女性盆腔感染、脑脓肿和厌氧菌骨髓炎等常有良好疗效。
2、克林霉素和林可霉素：克林霉素对大多数厌氧菌包括消化球菌、消化链球菌、类杆菌、梭杆菌、真杆菌、丙酸杆菌以及大多数放线菌属均有良好的抗菌活性。由于其对大肠杆菌和兼性革兰阴性菌很少有活性，故在治疗混合性感染时应加用其他抗菌药物如氨基苷类抗生素。
3、氯霉素：临床上常用于病因尚未明确的严重厌氧菌感染。
4、万古霉素和去甲万古霉素：对各种革兰阳性菌包括球菌与杆菌均有强大抗菌作用。
5、其他：厌氧菌对氨基苷类抗生素有抗药性；大多数厌氧菌除脆弱拟杆菌外，均对青霉素敏感；厌氧菌对四环素、红霉素的敏感性有差异，且在治疗中迅速产生抗药性。由于腹腔厌氧菌感染的常见致病菌为脆弱类杆菌、梭状芽胞杆菌和厌氧球菌，且常与兼性菌呈混合感染，推荐首选甲硝唑或克林霉素 ，次选为氯霉素，均应与庆大霉素等氨基苷类联合。
参考资料：[1]赵玉沛.中华医学百科全书 临床医学 普通外科学[J].北京:中国协和医科大学出版社,2017.6.