小孩排尿时阴茎疼痛，可能是因为泌尿系统感染导致，也可能是出现急性包皮炎所引起，要根据不同情况进行治疗。
1、泌尿系统感染：孩子可以出现尿频、尿急、尿痛的情况，这时需要带孩子及时到医院进行就诊，要对小便进行化验，同时也要化验血常规，明确具体的感染指标和感染情况，积极采取抗感染治疗，通常可以选择头孢类抗生素进行治疗。
2、急性包皮炎：也是比较常见的类型和原因，主要是由于不重视日常的局部卫生清洁，或由于平时清洁不到位引起的，在清洗儿童包皮时，一定要把包皮完全翻开，彻底清洗，这样才能达到有效防止粘连，防止局部发生感染的效果。
如果是由于急性包皮炎引起的小便疼痛，就需要到正规医院的泌尿外科处理。