反复发烧浑身疼痛一般与感染性疾病，如细菌感染、病毒感染，以及非感染性疾病有关。
1、感染性疾病：罹患该病后，治疗不彻底，或疗程不够，导致致病微生物未从人体内清除，当停药后或机体免疫力下降时，病原体繁殖增多，反复感染后，可以引起发烧症状。
建议患者及时、尽早去医院做常规检查，尽早明确病因，如果是细菌感染，应予抗生素治疗；病毒感染，采用抗病毒治疗；寄生虫感染要杀虫清除。当感染源去除后，反复发烧，浑身疼痛的症状才会消失。
2、非感染性疾病：如红斑狼疮，当治疗不彻底，或药物疗程不足等，狼疮细胞会有变化，导致反复发作，出现发热现象。
在未明确病因情况下，发烧浑身疼痛症状严重时，也可以暂时口服解热镇痛药缓解症状，但不建议长期应用。
发烧后由于伴随机体出现高代谢性的改变，会使患者新陈代谢加快，身体的骨骼肌收缩，导致短时间内会有无氧酵解，而产生的乳酸增多，乳酸刺激患者的肌肉神经，出现浑身疼痛的情况。