乳腺癌FISH检测指对乳腺癌的病理标本进行检测，以判断是否存在HER2基因扩增。FISH检测通常在高级别的医院进行，以保证检测的准确性。且免疫组化检测结果为阴性时，不需要进行FISH基因检测。
FISH检测是荧光原位免疫杂交的缩写，通过该检查来判断HER2基因的扩增情况。而乳腺癌是发生在乳腺的最常见的恶性肿瘤，一般在获得乳腺癌的病理标本之后，要做免疫组织化学的检测，确认HER2基因的扩增情况。
而同样如果免疫组化结果是1+，也定义为这个分子是阴性的。如果免疫组化检测发现HER2基因是3+的阳性，就可以确认HER2基因是阳性的，可以采用针对HER2基因的靶向药治疗。
而如果免疫组化检测HER2基因是2+的阳性，这个检测结果是不确定的，需要进行荧光原位免疫杂交，也就是FISH基因检测，来确认HER2基因是不是有扩增的情况。
如果FISH检测确认HER2基因是扩增的，就可以使用靶向药物进行治疗。而如果FISH检测结果HER2基因扩增是阴性的，就没必要使用靶向药物。