薏苡仁泡水喝或者煮水喝一般都比较好，薏苡仁泡水喝操作简便、对肠胃刺激小，煮水喝更利于成分释放、功效更佳，二者各有优劣，可根据自身情况选择，同时需注意体质与饮用频率。
从营养成分获取角度看，泡水喝能使薏苡仁中的部分有效成分溶出，如薏苡仁酯等。这种方式操作简便，可随时饮用，对于忙碌的现代人来说，能在一定程度上摄取薏苡仁的营养，发挥其健脾利湿之功。
煮水喝则更有利于薏苡仁有效成分的充分释放，在加热煮制过程中，薏苡仁内部的成分能更全面地溶解到水中，例如煮水可以更好地析出薏苡仁中的多糖等营养物质，增强其利水渗湿、清热排脓等功效，使保健效果更佳。
从消化吸收方面考虑，泡水喝相对温和，对肠胃的刺激较小。对于肠胃功能较弱的人，如果只是想获取少量薏苡仁的益处，泡水喝是一种合适的选择，不会给肠胃带来太大负担。而煮水喝虽然效果更好，但对于一些体质虚寒者，如果饮用频率过高或煮水浓度过高，可能会因薏苡仁的凉性而加重体内寒邪，影响脾胃运化，导致腹痛、腹泻等不适，不过适当饮用仍可接受。
从卫生角度而言，煮水过程有高温杀 菌的作用，能减少薏苡仁可能携带的微生物等杂质，相比之下，泡水喝可能会相对好一些。
无论是泡水还是煮水饮用薏苡仁，都要注意适量。若饮用后出现肠胃不适、体寒加重等情况，应减少饮用量或停止饮用。