结直肠癌化疗的方案临床上主要分两大类，一类是以奥沙利铂加氟尿嘧啶类为主的化疗方案，叫做FOLFOX方案；还有一类是奥沙利铂加卡培他滨，叫XELOX方案。
FOLFOX方案需要使用一种叫氟尿嘧啶的化疗药物，通过特殊的化疗泵46小时维持给药。伊立替康跟氟尿嘧啶联合使用的叫FOLFIRI方案，一般用于术后辅助化疗的病人，也可以用在晚期的病人。但是，伊立替康的FOLFIRI方案只能用在Ⅳ期病人，可以使病人肿瘤缩小，控制肿瘤。FOLFIRI方案不能用于术后辅助的病人，是因为临床试验显示FOLFIRI方案不能提高病人生存期。
两种化疗方案都含有5-氟尿嘧啶，5-氟尿嘧啶对心脏有毒性，年纪大、体弱伴有心脏病的患者可以选用雷替曲塞，毒副作用比较轻，对心脏的毒性比较小。