治疗尿道炎应根据病因选择药物，普通细菌感染首选头孢类或左氧氟沙星、喹诺酮类。左氧氟沙星在尿液中浓度较高，为治疗尿道炎首选药。对于特殊类型的细菌，头孢类和左氧氟沙星也为有效药物。此外，磷霉素治疗非发热性的下尿路感染非常有效。

其它特殊类型的感染，如支原体、衣原体感染，可选红霉素族，如阿奇霉素类药物，同时左氧氟沙星的抗菌谱中也对支原体和衣原体存在抑制作用，因此也可左氧氟沙星作为选择治疗。