目前对于卵巢早衰的病因尚不明确，可能为遗传性因素，如女方染色体45XO通常会出现卵巢早衰现象，而部分免疫性疾病患者也会出现卵巢早衰。对于特定酶缺乏或存在其它疾病的患者，也可能会出现卵巢早衰，如进行卵巢手术，常比未做卵巢手术患者更易出现。

此外，部分生活习惯不合理，如长期熬夜、缺乏锻炼、长期暴饮、暴食患者，也可能会出现卵巢早衰。但上述均不属于具体病因，若个体筛查卵巢早衰病因需到正规医院，进行针对性检查才可明确。