阴茎短的原因，一种是生理性的，一种是病理性的。具体如下：
1、生理性原因：人种不同、父母不同，人的阴茎有长有短，有大有小。但虽然短，但只要能够正常勃起，能够完成性交，都属于正常情况；
2、病理性原因：比如是先天遗传的。包括先天雄激素缺乏、发育迟缓等异常导致。这种阴茎属于真正的短小，基本在4cm以内，并且常常伴有其他方面的性征，比如阴毛少，喉结不突出，乳房发育等第二性征不明显。
所以遇到阴茎小的情况，首先要查明原因，看是否有遗传方面的问题。要查性激素，对内分泌进行检测。如果都没问题，就能够正常勃起，正常射精。没有性生活的时候，青春期能正常遗精，都属于正常现象。