牙根尖囊肿1cm算大。根尖囊肿通常由长期的慢性根尖周炎或不完备的根管治疗引起，当囊肿超过0.5cm时即视为较大，1cm则属于相对较大的。

牙根尖囊肿的治疗方法首先依据病变范围采取保守治疗，即进行完备的根管治疗，包括清除坏死发炎的牙髓组织、根管预备、冲洗清理髓腔残余坏死组织及封药根管充填。

治疗后需观察囊肿变化，若缩小则预后良好；若无变化，则可能需进行根尖手术，如根尖切除或根尖搔刮；对于特别严重的根尖囊肿，可能建议拔除牙齿后再进行手术治疗，以切除囊肿。