小拇指关节疼痛，往往最多见的是小拇指关节的骨关节病、退行性的骨关节病。
随着年龄的增长，或者用手的增多，手的着凉、劳累，会导致小拇指的关节，出现关节软骨的磨损，继发会引起小拇指的关节周围骨质增生的发生，这是一个最常见的引起小拇指关节疼痛的病因。
当然其他的病因，像有些类风湿性关节炎、痛风性关节炎，可能也会引起小拇指关节的疼痛、肿胀这样的情况。
还有小拇指关节局部，像因为指甲的感染、甲沟炎，也可能会引起小拇指关节化脓性的关节炎，也会引起小拇指关节的疼痛。
还有像小拇指的骨性结构的本身原发的骨髓细胞瘤、 骨囊肿、血管瘤等，也会引起小拇指关节的疼痛、肿胀。还有像转移性骨肿瘤，也会引起小拇指关节的疼痛。