临床治愈的标准指给予抗生素治疗，症状消失后72小时复查尿常规，连续复查2-3次即临床治愈；而痊愈指复查尿常规和尿培养，尿培养持续阴性，达到一定时间，比如半年以上或一年以上才为痊愈。
泌尿系感染通常需抗生素治疗，根据不同的泌尿系感染疾病，使用不同的抗生素，且泌尿系感染要选用敏感抗生素足疗程治疗。对常规膀胱炎治疗的时间较短，3-5天即可治好。对于急性肾盂肾炎和慢性肾盂肾炎的治疗较长，急性肾盂肾炎可能需治疗两周甚至以上的时间，使用抗生素治疗两周后，复查尿常规和尿培养。如果尿培养转阴，说明急性肾盂肾炎得到控制，而慢性肾盂 肾炎可能需要治疗更长时间。