胆总管手术后，很多患者出现消化道的不适症状，身体需要适应，短则几个月，长则0.5-1年。患者通过正常的生活调整，辅助使用药物通常能够度过。建议术后禁油腻，少食多餐不可暴饮暴食，以免引起肠道的逆蠕动和胆汁的异常分泌。若患者进食后出现胃胀和消化道不良的表现，可通过物理热敷、按摩，帮助肠道功能逐渐恢复。若出现非常严重的胃胀和腹痛症状，需警惕吻合口或肠道出现其他病理性改变的可能，应立即到医院就诊。
胆总管手术切除膨大的胆总管，将肠道和胆管进行吻合，胆汁通过胆肠吻合口直接排 入肠道，解决胆总管囊肿的问题。但由于肠道蠕动和生理路径发生变化，患者会出现胃胀、消化不良、腹泻或恶心、烧心的症状。肠液逆蠕动较强时会反流到肝脏的胆道系统内，导致患者出现发烧、肝区疼痛等症状。