当患者咳嗽咳出黄绿色脓痰时，通常提示支气管感染、肺部感染，是化脓菌感染导致，比如金黄色葡萄球菌、肺炎球菌、铜绿假单胞菌、革兰氏阳性球菌、革兰氏阴性杆菌感染。慢性支气管扩张的患者，由于支气管壁结构性改变，使支气管呈囊性柱状扩张，局部炎症和局部分泌物不能较快排出体内，而在支气管内蓄积，此时细菌会进行繁殖。
随空气吸进来的革兰氏阳性球菌、革兰氏阴性杆菌等，在肺局部生长繁殖，与脱落的上皮细胞、黏液共同形成黄绿色脓痰。细菌感染时可以导致局部感染，而出现黄绿色脓痰，全身并没有发热，不会出现全身炎症反应症状。但有些患者会先发热，再出现黄绿色脓痰，即病原菌首先导致全身炎症反应，产生不同的体温，其次导致局部炎症，产生少量、中等量或者大量的黄绿色脓痰。当患者出现黄绿色脓痰时，即提示局部存在化脓菌感染。