艾灸时产生的烟味对呼吸道有害，但需要根据接触的密度与时间的长短而定。若关节或经络中有寒气，偶尔艾灸熏1次不会造成较大伤害，如不会造成慢性阻塞性肺疾病或气管炎等。长期处于烟草环境下会对身体造成伤害，无论是普通烟草，还是艾叶烟草，甚至燃香的烟味，吸入过多均会对肺部造成伤害。
肺内黏膜上有黏液，烟携带着灰尘进入，机体的黏液包裹异物才能将其送出。偶尔1次吸入不会造成肺病，长期吸入会消耗肺内阴液，甚至导致肺虚。一旦肺无法排出烟草的灰尘，造成长期、慢性刺激，可能会导致气道弹性下降以及刺激局部产生结节、增生。