经腹壁B超扫查除腹部有尚未愈合的伤口不宜经腹部扫查外，但也并非绝对禁忌症，则没有其它特别禁忌症。经腹部扫查范围广，但对盆腔内小病灶分辨力较差，检查结果容易受被检者的腹壁脂肪、子宫位置等条件影响。被检查者应该适度充盈膀胱，避免长期干扰盆腔内子宫附件的观察，注意膀胱过度充盈状态下也会影响检查结果。
经阴道B超扫查是重要的妇科超声检查途径，探头和盆腔器官距离较近，图像分辨率较好，可以获得更丰富、更准确的诊断信息，受检者不需要充盈膀胱。该检查不受肥胖影响，有性生活史的女性建议采用经阴道超声的检查方法。
但是对于卵巢位置偏高、子宫病变过大使病变位置偏高，剖宫产以后宫颈与周围组织粘连导致宫颈拉得过长，宫体位置偏高的患者，都不适合做经阴道超声检查。经阴道超声检查时需要排空膀胱，采用截石位暴露外阴，平时工作中患者对经阴道检查存在一定的恐惧心理，还未检查就开始紧张，其实只要心情放松，这种检查方法则无任何不适感。