乳腺增生一旦进入手术阶段，并不是进行全乳房切除，一般只对怀疑有乳腺癌存在的部位进行局部切除、病检。实际上大部分病人不愿意手术治疗时，可以通过超声或者钼靶引导下进行局部穿刺，取得一定量的组织进行病检，基本上可满足临床诊断需要。但需要注意的是，穿刺的组织量相对少，只对所穿出的组织负责，并不像手术切除时，把怀疑部位整体切除进行病检，所以手术准确性较好。全乳切除较少，几乎没有。
乳腺增生初期很多不需要手术治疗，可通过中成药或者抗雌激素治疗进行控制。只有通过影像学发现有异常结节，或者钼靶上发现有钙化、结构扭曲，或者虽然没有异常影像学 发现，但是局部有明显肿物，通过一段时间的治疗不见缩小，反而增大的情况下才需要手术治疗。