儿童时期畸胎瘤，不都是恶性肿瘤。儿童时期畸胎瘤大多数是成熟型畸胎瘤，属于良性，恶性占比较少。畸胎瘤是生殖细胞肿瘤的一类，畸胎瘤又分为成熟型，成熟型畸胎瘤属于良性，分为单胚成型畸胎瘤、未成熟型畸胎瘤，以及成熟型畸胎瘤半体细胞恶变类型。成熟型占畸胎瘤大部分，成熟型中大部分属于良性肿瘤，所以儿童时期的畸胎瘤以良性肿瘤为主。
少数恶性类型畸胎瘤，如成熟型半体细胞恶变、卵黄囊瘤、无性细胞瘤、精原细胞瘤、胚胎性癌、绒毛膜癌、混合型生殖细胞肿瘤、性腺母细胞瘤、未成熟畸胎瘤Ⅱ级、未成熟畸胎 瘤Ⅲ级等，有恶性倾向。临床上需要到儿童肿瘤外科专科就诊，根据病理、肿瘤标志物、甲胎蛋白或者人绒毛膜促性腺激素(HCG)，进行综合诊断以及治疗。