黄杆菌感染肺部引起的肺炎称为黄杆菌肺炎，此菌为机会致病菌，多发生于机体免疫力低下伴有严重基础疾病的患者，一般较难治愈。常见临床表现为发热、剧烈咳嗽、咳痰等，发热以轻度或中度不规则发热为主，部分为弛张热，重症体温较高，咳痰为黏稠黄色脓样痰。婴儿感染后存在神态萎靡、少动、少哭、拒食、呕吐等中毒症状。
X线检查可见肺炎改变，血常规白细胞计数明显升高，中性粒细胞可达90%以上，存在核左移现象，血沉常增快，合并多脏器功能衰竭以及败血症等。肾功能等多项检查异常，心电图异常改变及心律失常，痰液或胸腔积液细菌培养可发现黄杆菌。本病胸腔积液较常见，浆液性或血性胸水常规进行细菌培养，阳性检出率较高。