临床上较为常见的是把氯低于117mmol/L作为界限，氯低不代表是真菌性脑膜炎，与结核相比，结核性脑膜炎或者结核杆菌容易嗜氯，对氯的需求较多。通常血中的氯低于脑脊液中的氯，脑脊液的氯下降与血液中的氯下降存在相关性。脑膜炎病人经常会出现食欲不佳情况，血氯可以降低，因此脑脊液氯的降低程度要根据血液中氯的浓度决定，如果血液中氯降低，脑脊液的氯通常也会降低。
真菌性脑膜炎的判断不以氯化物为标准，更多的是看涂片或培养是否找到真菌，比如新型隐球菌，可以通过染色确定，这是金标准。其他的特征，比如糖降低、细胞数增高、蛋白的量增高等，是脑膜炎的标准。具体症状应根据具体情况进行分析，尤其是要结合临床改变进行分析。