病态窦房结综合征病因主要是由于窦房结及其周围组织病变引起。这些病变存在可逆因素和不可逆因素。对于可去除的诱因，这类患者病态窦房结综合征可以治愈。药物导致窦房结功能异常，比如洋地黄药物或者这类药物中毒，这类药物代谢完，或者通过治疗加速代谢，去除诱因后，病态窦房结综合征可以改善。
还有一类常见的在急性心肌梗死中，由于窦房结动脉供血受到影响，而产生的病态窦房结综合征。在通过介入、溶栓等方法，去除缺血导致的窦房结功能异常，这类病态窦房结综合征可以治愈。但是一部分患者窦房结功能产生不可逆损伤，导致窦房结部分或全部损伤，而发生不可逆性病变时，则不可治愈。现在的医学在不断进步，现在有了起搏器，植入永久起搏器，可以在一定程度上代替病态窦房结的功能，这类患者虽然不能治愈，但是可以获得很好的治疗效果。