扁桃体发炎做手术后复发几率较小，采取手术方法治疗的一般是慢性扁桃体炎，慢性扁桃体炎有严格的手术适应症。如果慢性扁桃体炎反复发作超过3次/年，同时伴有发热等全身症状时建议进行手术治疗。如果慢性扁桃体炎发作的同时，伴有全身并发症，比如血小板减少性紫癜、心内膜炎、关节炎、肾炎等，建议进行手术治疗。此外慢性扁桃体炎急性发作时，如果伴有扁周炎、扁桃体周围脓肿，建议进行手术治疗。
如果患者手术不当，即在扁桃体切除过程中部分扁桃体残留，可能会出现扁桃体残体发炎，而引起复发。因此进行扁桃体手术时，要掌握手术适应症，以及要严格执行手术操作，如此可以降低扁桃体术后的复发几率。