胆固醇代谢异常的原因较复杂，目前主要有以下原因：
1、遗传因素：属于不可改变和控制的因素，因其涉及到基因层面对胆固醇代谢的整体调控，所以遗传因素影响胆固醇代谢占比较高。部分患者家族本身易出现胆固醇代谢异常，表现为低密度脂蛋白胆固醇升高，早发冠心病或家族性高胆固醇血症，且可引发动脉硬化，因此遗传因素在整个胆固醇代谢中占据较重要地位；
2、激素调节：如围绝经期女性在激素水平下降过程中易出现胆固醇代谢异常，表现为低密度脂蛋白、胆固醇增加和总胆固醇增加，与激素调节有一定关系；
3、胆固醇代谢异常：与肝脏因素或自身清除机制有一定关系，需要进行药物干预与治疗。