骨髓纤维化目前最新治疗办法是使用JAK2抑制剂，即芦可替尼，经过药物治疗后骨髓纤维化疗效会明显提升，尤其在缩小脾脏方面疗效较好。再就是强心药或干扰素治疗，还有刺激红细胞生成方面。如果出现贫血，需要采取刺激红细胞生成方面的治疗，包括雄性激素、EPO等，但目前上述药物的治疗都无法根治骨髓纤维化。
唯一能够根治骨髓纤维化的治疗办法是异基因造血干细胞移植，此种疾病做异基因造血干细胞移植的病例数目非常少，主要原因是该疾病发病年龄往往都比较高，很难找到供者。另外，因为年龄高，患者很难耐受异基因造血干细胞移植副作用，但是能够治愈骨髓纤维化的唯一治疗手段。