结膜炎睡觉起来会更严重的原因，主要有以下几点：
1、结膜囊内温度高：由于睡觉的时候眼睑闭合，在闭合的眼睑里结膜囊内的温度比较高，如果原来在睡觉之前已经有结膜的炎症，由于闭眼时间过久结膜囊温度过高，细菌繁殖比较快，大量的细菌繁殖会刺激结膜炎症更加严重，因此第2天晨起感觉眼睛酸、涩、流泪，甚至大量的分泌物将眼睛粘住；
2、泪液循环减慢：由于正常的泪液里含有溶菌酶，对结膜囊的细菌有清洁作用，如果长期闭眼以后，眼泪循环的比较慢，溶菌酶相应也少，因此晚上在休息以后，结膜囊内的炎症在第2天晨起感觉更严重。这时可以用敏感的抗生素滴眼液，反复、频繁滴眼，保持结膜囊内药物的浓度。在正确的药物治疗下，结膜囊的炎症较快可以得到控制。