克汀病是由于碘缺乏引起，采用补碘的干预措施后，如碘盐、碘油，地方性的克汀病症状可以得到纠正。但是有一部分有甲状腺萎缩的黏液水肿型的克汀病，补碘无效或效果不佳，这部分人需要长期的甲状腺激素替代治疗，部分有甲状腺完全萎缩的病人需要终身的服甲状腺激素。所以应尽早的服用甲状腺粉片剂或甲状腺激素，可以取得一定的疗效，能够很快纠正黏液性水肿以及其他的甲减症状，使体格进一步发育，性发育迟缓也能够得到改善。听力障碍以及智力落后，能在有限程度上有部分的改善，但不能够彻底治愈。
治疗先从小剂量甲状腺激素开始补，逐渐增量。在1-3个月内达到全量，在连续使用过程中要特别注意观察疗效，疗效满意后再调整剂量。如果恢复一部分甲状腺功能，也可以适当的减少剂量，也需要配合激素的治疗，适当的补充各种维生素、蛋白质。对16岁以上的患者，根据情况还可以加服用性激素。