SPECT-CT检查时根据患者检查项目决定，首先由医师开具检查单，患者来核医学科预约。预约时医师会问一些情况，然后告诉检查时需要带的资料，检查前的准备，然后准时到核医学科候诊就可以。在检查当日，进行显像剂的注射。注射后一定的时间在候诊室里等候，然后进行摄片，即可以完成SPECT-CT检查。SPECT-CT的检查，总体来说检查过程比较简单，没有过多的特殊准备。
不同的检查项目，注射方式不同，大多数检查通过静脉注射，但是对于肾动态检查，静脉注射要求是弹丸注射，注射显像剂要求快速注入静脉内，而且不允许有渗漏。对于肺灌注显像，要求患者平卧位，不能坐着打针。对于淋巴显像是皮下注射。下肢淋巴显像要求注射双脚趾的第一和第四趾蹼。对于上肢淋巴显像是注射双手第一和第四指蹼，这是皮下注射。