过去发现HER2阳性乳腺癌复发率，比HER2阴性乳腺癌复发率低，现在有划时代药物，如抗HER2的赫赛汀(曲妥珠单抗)、帕妥珠单抗，或者其他药物。HER2阳性乳腺癌如果接受正规的抗HER2治疗，相较于HER2阴性乳腺癌的生存率、复发率，基本能达到平齐，但如果不做抗HER2治疗，复发率会更高。
如果是导管内癌，一般不做抗HER2治疗，此种情况若是导管内癌HER2阳性，可能复发率更高，但导管内癌整体复发率偏低，因此不用过于在意。如果是HER2阳性乳腺癌，建议能使用靶向治疗尽量使用，现在治疗费用比较便宜，并且在医保范围内。
如果应用单靶或者双靶治疗，早期乳腺癌复发率较低，与普通HER2乳腺癌复发率相比，可能达到接近或者略高，疗效非常好，并不是很严重的问题。HER2阳性乳腺癌复发率整体可能更高，但通过抗HER2治疗，疗效非常不错。
特别是新辅助化疗，如果是HER2阴性和阳性病人，可能PCR率能达到80%-90%以上，三阳性病人的PCR率可能达到50%-60%。