骶管囊肿不会自己消失，但是大多数的骶管囊肿患者并没有特殊的症状，因此无需过于担心。此类患者应进行临床随访观察，每隔1-2年做1次相关的影像学检查，密切关注骶管囊肿的变化。
如果患者在观察过程中囊肿出现明显的增大，甚至出现明显的症状，包括臀部、大腿后侧、内侧、小腿外侧局部的疼痛以及性交痛，在排除腰间盘突出、椎管狭窄、骶管肿瘤等疾病后，应对骶管囊肿进行相应的手术处理。对于此类患者，通过手术将骶管囊肿进行完整的切除，通常可以获得比较好的效果，达到治愈目的，不影响寿命。因此，广大患者不必过于担心，如果确诊存在骶管囊肿，应到正规医院进行相应的处理。