一般五子衍宗丸和六味地黄丸能同吃，但需要由专业医生评估后使用。
五子衍宗丸具有补肾益精的功效，用于肾虚精亏所致的阳痿不育、遗精早泄、腰痛、尿后余沥。并且该药包括多种剂型，其中浓缩丸剂型是通过全部植物中药材提取药物有效成分并浓缩而成，提高了药物中有效成分的浓度，生药含量大，单次服用剂量小，且不含糖分，血糖高者也可以服用；而六味地黄丸具有滋阴补肾的功效，用于肾阴亏损所致的头晕耳鸣、腰膝酸软、骨蒸潮热、盗汗遗精、消渴的患者。
从药物组成上看，二者之间没有相互冲突的成分，是可以一起服用的。并且五子衍宗丸主要补肾益精，六味地黄丸主要滋补肾阴。在中医理论中，肾精亏虚和肾阴虚之间存在一定的相互影响关系。肾精是化生肾阴的物质基础，肾阴虚的患者必伴有肾精不足的情况；而肾精亏虚则可能会进一步加重肾阴虚。所以，对于同时存在肾精亏虚和肾阴虚的患者，将五子衍宗丸与六味地黄丸一起服用，可以起到相辅相成的作用。
当然，是否可以一起吃还是要经过医生的辨证论治后确定，同时用药过程中注意观察有无不适症状。