月经未完全干净时同房，有可能发生意外妊娠。具体如下：
1、对于月经周期28-30天的女性，在月经完全干净时，即可能是月经第7-8天，理论上此时并非女性排卵期，所以同房后发生意外妊娠的可能性较低。但由于环境压力或情绪刺激，可能出现意外排卵，所以此时同房也可能会发生意外妊娠；
2、对于月经周期较短，周期21-23天的女性，一般在月经即将干净前，已进入排卵期，此时同房反而会增加受孕几率。
因此女性在月经未完全干净时，同房可能会受孕。同时由于月经血刺激会增加感染风险，或增加经血逆流导致盆腔子宫内膜异位症的风险，所以建议女性在月经未完全干净时不应同房。