反流性食管炎与浅表性胃炎均属于酸相关性疾病，对于两种疾病用药的首选为质子泵抑制剂，即给予抑酸治疗，可选择兰索拉唑、雷贝拉唑、奥美拉唑、泮托拉唑、艾普拉唑等药物。对于反流性食管炎治疗疗程为4-8周，而对于浅表性胃炎需根据不同情况而论。
如果由于幽门螺杆菌感染引起胃部炎症，此时需进行根除幽门螺杆菌治疗，治疗疗程为14天即2周，主要选择四联疗法，即1种质子泵抑制剂加2种抗生素加1种铋剂。质子泵抑制剂可选择兰索拉唑、雷贝拉唑、奥美拉唑、泮托拉唑、艾普拉唑等药物，抗生素可选择阿莫西林、多西环素、呋喃唑酮中的两种，而铋剂可选择胶体果胶铋 、枸橼酸铋钾等药物种的一种。在患者服药期间大便或舌质可能呈黑色，此时可能与铋剂相关，需与患者沟通清楚，避免造成患者心理负担。