新型冠状病毒感染，大部分人表现为呼吸道症状，以肺炎为主，少数人可能会有结膜炎和腹泻症状。重型危重型病例里，其并发症会更多，比如会有急性呼吸窘迫综合征ARDS，这也是导致重型危重型病例出现呼吸困难的主要原因，甚至是危及生命的主要原因。还可能会有心脏损伤，心律失常以及心肌损伤，可能会有极少数危重型病例会有心力衰竭、肾损伤。很多危重型的病例在终末期会出现肾功能衰竭，需要通过肾脏的替代治疗，以及可能会有人会出现脑炎表现，当然都非常少见。
最常见的还是呼吸衰竭，即急性呼吸窘迫综合征。在极个别的长期住院患者中，还可能会有医院获得性感染即院内感染，院内感染往往是细菌，尤其是耐药细菌感染。新型冠状病毒感染是一种病毒感染，不提倡用抗生素治疗，但是如果是长时间住院合并院内感染，可能需要使用比较强的抗生素治疗。