临床上对于儿童和成人扁桃体发炎的原则不一样，儿童3岁以后上幼儿园，经常接触外部环境，扁桃体容易受刺激引起发炎。这时医生会开抗生素，原则是足量、足疗程，把炎症彻底消灭，不容易产生耐药性。
成人扁桃体经常发炎，每年4次以上，每次都有脓点，需要用抗生素治疗，也可以考虑手术切除。绝大部分成人扁桃体都已经萎缩，对身体没有较强的防御能力。而在扁桃体周围也有其他的淋巴组织，同样可以起到防御功能。
所以这时如果扁桃体经常没防御能力，可以考虑手术切除，把扁桃体切除之后，周围淋巴组织会对咽喉起防御功能，对身体没有影响。