目前甲状腺功能减退无法根治，甲状腺功能减退是一种自身免疫损伤的结果，免疫系统将甲状腺误认为是敌人，而进行攻击破坏，导致甲状腺分泌合成甲状腺激素的细胞受到破坏。由于其它的组织器官无法代替甲状腺，所以甲状腺功能减退患者，需终身补充甲状腺激素。
常用补充甲状腺激素药物包括左甲状腺素片和甲状腺素片，甲状腺素片为T3、T4复合制剂，一般由动物身上提取，但临床上基本不使用。左甲状腺素片的主要成分是T4，不包含T3成分，所以使用起来更方便、安全，效果也较好。补充左甲状腺素片应注意空腹口服，至少0.5小时，甚至1小时后再进餐，因为左甲状腺素片不易 消化吸收，与食物混合会影响药物的吸收，不利于疗效。