手指再植术后康复训练也非常重要，因为在手指离断之后，做断指再植手术，不单为保留外观，更重要的是恢复手指功能。如果不进行良好的康复训练，手术也失去意义。一般断指再植手术需要固定指骨、屈伸指肌腱、神经、血管、皮肤，之后需要外固定四周，从四周之后才可以康复训练。一般肌腱愈合的时间是3-4周，所以从3-4周拆石膏之后，可以做手指屈伸活动锻炼，特别是被动屈伸活动锻炼，包括加上主动屈伸活动锻炼。但锻炼的力度也不能过大，因为骨折愈合还不够坚强，过早锻炼特别是被动活动的力量太大时，会造成局部应力，导致指骨的愈合受到影响，甚至造成指骨的不愈合。
一般术后到6-8周时，指骨已经达到一定的愈合牢固程度，可以加强手指屈伸训练的幅度。而一般八周以后手指的内固定去除，可以加强各种锻炼，比如通过蜡疗或主动握力球等康复训练。一方面促进 骨折的愈合，另一方面通过肌腱功能的恢复改善后期的功能。