喉咙长痘痘常见于以下原因：
一、滤泡性咽炎：
1、多因上呼吸道感染而诱发，也可能由于上呼吸道感染的分泌物刺激导致；
2、如果受到外界空气污染，恶性气体刺激也容易引起慢性咽炎；
3、由于胃食道反流引起胃酸刺激喉咙，也容易引起慢性咽炎，表现为喉咙长痘痘。检查发现咽黏膜慢性充血，咽后壁散在淋巴滤泡增生。
二、疱疹性咽峡炎：
多因病毒感染导致，常发生于儿童，在季节变换时容易发病。多为柯萨奇病毒感染，感染早期表现为咽痛、咽干，咽部可以出现散在疱疹，即所谓的喉咙里长痘痘。随着病程延长，疱疹破溃形成溃疡，患者会出现发热、 咽痛、精神食欲差等症状。
三、肿瘤：
喉咙长痘痘有可能是由于咽喉部的良恶性肿瘤导致，必要时行电子喉镜检查，以早期诊断、早期治疗。