通常不建议用激光治疗咽喉炎，并不能有效治疗咽喉炎，而且可能出现并发症。咽喉炎常见原因，包括空气污染、烟酒刺激、过度用声等，难以避免黏膜慢性损害，长时间咽喉炎，咽部可能出现颗粒样小疙瘩增生，称为黏膜上淋巴滤泡。相当于手部硬茧，如果劳动过多，手部上皮增生会出现硬茧，而黏膜上淋巴滤泡结节，对健康没有危害。
如果用激光、等离子消融或其他手术方式，将此类滤泡处理，可能出现瘢痕愈合，从而造成黏膜加温、加湿的功能被破坏，可能出现咽干或吞咽不适感。黏膜上淋巴滤泡，通常对炎症有抵抗作用，即使将出 现滤泡切除，其他正常黏膜仍受到刺激，再出现新的滤泡，较难做到切除干净不再发作。