根据美国口腔颌面病理学会于2016年提出的新的诊断口腔扁平苔藓的诊断标准，以及2003年WHO所发布改良的诊断口腔扁平苔藓的标准，对于首次来就诊的口腔扁平苔藓患者，要详细询问病史，包括系统性疾病史、吸烟等不良嗜好史，以及在疾病发作时是否与药物、食物等有关，还要进行详细临床检查，同时也要做组织病理学检测，必要时还可以做直接免疫荧光检测。
为了了解患者当时的身体基础情况，以及排除相关的可能病因，可以做辅助检查，如血尿常规、肝肾功能、血糖等检测，还有免疫功能检测。如果是女性患者，疾病的发生、发展与月经等有关，还可以进一步检测患者性激素水平。对于有心理、精神方面的创伤患者，必要时还可以做心理评估。