如果出现消化不良，艾灸时会选择腹部、下肢部和后背部的穴位。消化不良是一种脾胃不和的表现，会引起患者食欲不振、腹胀、腹痛、便秘、腹泻等症状。艾灸时选择腹部的上脘、中脘、下脘、巨阙、滑肉门、天枢、大横等这一类穴位来调和脾胃，下肢部可以选择足三里、上巨虚、下巨虚、三阴交等同样具有调和脾胃的作用，同时还会配合后背部的脾俞、肾俞、胃俞等一起调和脾胃。
脾胃不和是经常出现的一种状况，可以选择艾灸的方式来进行治疗调养，很多人脾胃不和是因为气虚或者气阴两虚，这时还可以加用下腹部的气海、关元穴来益气温阳、调和脾胃。