甲状腺过氧化物酶抗体浓度可以升高，但是正常值在不同实验室使用不同试剂盒单位不同，结果是不同的，一般＜30IU/ml。
抗甲状腺过氧化物酶抗体存在于甲状腺细胞内微粒体当中，称为抗甲状腺过氧化物酶抗体，是微粒体的主要组成部分。甲状腺过氧化物酶是潜在自身抗原，从细胞内向细胞外泄漏时，刺激机体产生抗甲状腺过氧化物酶抗体。
抗甲状腺过氧化物酶抗体测定有助于自身免疫性疾病诊断。90%以上慢性淋巴细胞性甲状腺炎患者具有高浓度抗甲状腺过氧化物酶抗体，70%的Graves病患者甲状腺过氧化物酶抗体浓度升高。
抗甲状腺过氧化物酶抗体阳性的同时，要测定促甲状腺功能，即T3、T4、TSH水平，综合判断是否存在慢性淋巴细胞性甲状腺炎或Graves病。