腔隙性脑梗死是脑的深穿支小动脉的闭塞，多数都是由于动脉粥样硬化或者动脉硬化所导致。而双侧的基底节的腔隙性脑梗死的常见原因如下：
1、长期高血压如果控制不好，由于长期的压力对于血管壁的作用，使得血管的弹性下降，从病理的结果就可以看到有小动脉的玻璃样变，也就是动脉硬化；
2、糖尿病的患者，如果血糖控制不好，就会比没有糖尿病的人更容易发生大动脉的粥样硬化，还有糖尿病的小血管的病变以及微血管的病变；
3、高脂血症，还有患者如果经常吸烟饮酒这些嗜好，还有如果患者有高尿酸血症、高酮性半胱氨酸血症等，这些都可以促进 动脉粥样硬化还有小血管的损害。
由于这种损害它是广泛的，所以一定会累及双侧的脑部，导致双侧基底节区的腔隙性的脑梗死，这些双侧多发的腔隙病灶看起来有的是新病灶，有的是旧病灶，就是先后发生了，在不同阶段形成的，但它原因都一样。