细菌感染发生低烧的原因主要如下：
1、细菌毒力较低：细菌是外来的病原菌，且常具有不同程度毒力的病原体细菌，在细菌感染人体后，可以不断繁殖、播散而产生各种毒素，导致感染的个体出现不同程度的发热。发热可以为高热，如40℃，可以是中等度发热，也可以低热。低热通常是毒力较低的病原菌感染，也有某些容易出现低热的病原菌，比如结核杆菌、非结核分枝杆菌、布氏杆菌、凝固酶阴性葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌，是毒力相对较低的病原菌；
2、患者免疫功能低下：也有人认为机体免疫功能较低下，对细菌感染可能无法做出相应反应，而可能体温出现低热的情况 。比如老年人，或进行大手术后、器官移植应用免疫抑制剂的人群，发生毒力比较高的细菌感染，也可以表现为低热。