龟头、包皮发炎所用药物分为口服药物与外用药物，但以外用药物为主。通常针对细菌与霉菌感染，使用药物有区别，主要内容如下：
一、外用药物：
1、细菌感染：通常使用莫匹罗星或夫西地酸乳膏、红霉素乳膏、金霉素乳膏等，此类抗生素药膏对常见细菌感染，均有较好治疗作用，通常涂抹药膏间隙可以配合外用洗液治疗；
2、真菌感染：通常要用专门抗真菌药膏，如咪康唑乳膏、克霉唑乳膏等，此类药物对于真菌感染效果较好，而普通抗生素药膏对真菌感染效果较差。涂抹药膏间隙，通常使用刺激性较小清洗液，如硼酸洗液、洗必泰溶液、聚维酮碘溶液、皮肤康洗液等，可以根据敏感程度不同，使用原液或者勾兑后使用；
3、合并感染：部分药物如几丁糖又称壳聚糖，此类属于喷剂，对于细菌、真菌均有治疗作用，可以穿插使用。
二、口服药物：
通常对于严重的包皮龟头炎可以配合口服头孢类药物、喹诺酮类药物、大环内酯类药物以及抗霉菌药物，比如氟康唑、伊曲康唑等。